本殿南側にビルに囲まれるように立っている大イチョウがあります。注連縄が巻かれた御神木で、京都市の保存樹に指定されています。
「菅大臣神社 銀杏黄葉と境内社」の壁紙はWUXGAディスプレイ(1920x1200ドット)との整合でオリジナル写真の上下を多少カットしてあります。